Model alternatif organisasi GIS didasarkan pada perbedaan lingkup GIS, tingkat integrasi GIS dalam operasional bisnis, tingkat sentralisasi operasi dan penggunaan GIS, dan tingkat sentralisasi manajemen kontrol. Secara umum model organisasi GIS dapat diklasifikasi dalam 3 tipe ; (1) Entreprise GIS, (2) GIS data and service resource, dan (3) GIS as business tool.